Na esfera das instituições privadas, poucas associações se aventuraram a elaborar cadastros com âmbito nacional. Dentre estas, destacam-se os trabalhos do ISER - Instituto de Estudos da Religião que, em 1988, publicou uma pesquisa organizada por Leilah Landin, intitulada "Sem Fins Lucrativos: As organizações não governamentais no Brasil". O livro contém informações sobre 422 instituições na categoria "Organizações a Serviço do Movimento Popular - SMP", 184 instituições na categoria "Organizações de Mulheres", e 402 instituições na categoria "Organizações Ecológicas".

Em 1996, o ISER edita a obra "ONGs: Um perfil - Cadastro das filiadas à Associação Brasileira de ONGs (ABONG)", organizado por Leilah Landin e Lecticia Ligneul Cotrim, na qual constam o endereço e o perfil de 145 associações afiliadas à ABONG.

Em 1992, a Ecopress - Agência de Notícias Ambientais, publica a "Agenda de Entidades Ambientalistas Ecopress 92", contendo registros de 70 ONGs de todo o Brasil.

Entre 1988 e 1991 o Mater Natura realizou trabalhos internos de coleta e sistematização dos registros da Ecolista, sendo que em 1992 firmou parceria com o WWF, que financiou a publicação de 3.000 exemplares, amplamente distribuídos no Brasil e no exterior. Lançada em dezembro de 1992, a primeira edição da Ecolista fornecia informações sobre 1.891 instituições, sendo 1.533 ONGs e 358 órgãos governamentais.

Uma segunda edição revisada e ampliada da Ecolista foi editada em novembro de 1996, ainda em co-execução com o WWF, mas também com novos parceiros e colaboradores, cujo leque institucional abrangia o Ministério do Meio Ambiente - MMA (através do Fundo Nacional do Meio Ambiente - FNMA), UNICEF, o Instituto de Estudos da Religião - ISER e as empresas Microsoft do Brasil, Xerox do Brasil e a Telepar - Empresa Paranaense de Telecomunicações.

A edição de 1996 acrescentou informações adicionais aos endereços das instituições, permitindo traçar um perfil destas. Foram disponibilizados 1.035 registros, sendo 725 de ONGs, 260 de órgãos governamentais e 50 de redes e coletivos de instituições.

A atual fase deste Cadastro, denominada de ECOLISTA Online, iniciou-se em janeiro de 2004, com a apresentação de projeto submetido à apreciação da Petrobras - Petróleo Brasileiro S.A. Em dezembro de 2004 foi firmado contrato de parceria e patrocínio entre a empresa e o Mater Natura, visando a execução do projeto. O item do presente site denominado "Metodologia" descreve o processo de implantação e de manutenção da ECOLISTA online.